Bilimsel ve tıbbi literatürde sürekli olarak bildirilen tek belirli yan etki, kilo alımı oldu. Ancak mide sorunları, kas krampları, dehidrasyon ve artan kas gerginliği/incinmesi gibi birtakım yan etkiler de rapor edildi.
Kreatin takviyelerinin kısa ve/veya uzun vadeli kullanımında, renal (böbrek) gerginliğin artacağına dair endişeler de bulunuyor.
Bir araştırma grubu, kreatin takviyelerinin bireylerde anterior kompartman sendromu (ACS) oluşumu riskini artırdığını ileri sürdü. Son birkaç yıldır, birtakım çalışmalar kreatinin bu problemlerle ilişkisinin olmadığını ve ACS oluşumu ihtimalini artırmadığını gösterdi. Aslında, kısa süre önce elde edilen bir kanıta göre kreatin, antrenman yapan atletlerde ısı gerilimini azaltıp kas-iskelet sistemiyle ilgili sakatlık eğilimini düşürüyor. Kreatin alan kişiler bu problemlerden bazılarını deneyimlese de kreatin kullananların bunu yaşama oranı plasebo alan deneklerden daha yüksek değil ve hatta bazı durumlarda daha düşük.